创立了“戾气”病因学说，强调瘟疫与伤寒完全不同，明确指出“夫瘟疫之为病，非风、非寒、非暑、非湿，乃天地间别有一种异气所感”。创立了表里九传辨证论治思维模式，创制了达原饮等治疗温疫的有效方剂。对后世瘟病学的形成与发展产生了深远影响。
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